神秘商店可以说是游戏里最重要的系统之一，极品装备、顶级侠客、进阶心法都能在神秘商店换取而来，当然前提是要有足够的器魂和侠魂。
神秘商店每两小时更新一次，如果两小时期间没有上游戏，刷新次数会根据VIP等级积累，VIP等级越高能累计的次数就越多。
除了等待自动刷新之外，还可以用元宝或者刷新令刷新，每20元宝刷新一次，每一个刷新令刷新一次。刷新令可以通过登陆奖励、升级礼包、日常任务等途径获得，一般每天能够获得20个左右。在有魂的前提下，就能愉快的刷一把啦！
侠客
在神秘商店里有一种必须换的东西--第一排侠客碎片，这是必须换取的，不管什么情况下都得保留足够的魂换取第一排碎片，然后根据自己阵容走向换取有需要的侠客碎片（如果遇到叶孤城，谢晓峰 建议一定要换取，这两人可以说是各种阵容搭配中心，不管你是什么阵容走向这两人都是不可缺少的）。
神秘能刷出所有5星侠客卡碎片，也会出现整卡，目前百晓生侠客图鉴里面前三排外加一个公子羽 只会有碎片出现（50碎片合成），其他的5星侠客卡（30碎片合成）会出现整卡而且是定向卡，也就是你点击看到的是攻击卡换取之后就是攻击的，看到的是防御卡换取之后就是防御的。碎片合成的侠客卡片攻防是随机的（侠魂换取）。
