美漫的画面风格以及剧情的穿插在给玩家带来新鲜感受之余，也带来了更多游戏动力。游戏整体内容可以说就是刷图，战斗，提升等级，购买装备，战斗……循环往复，通过多次战斗来获取小关卡的通关等级。关卡等级评定也仅以玩家的通关次数（第一次1星，第三次2星，第六次3星）为标准，游戏借由此增加玩家的游戏时间和适应过程，当然后续过不去关卡是也只有重复刷前面的关卡进行提升一途。游戏6大地图，72个小关卡，想要拿到所有关卡3星还是非常耗费时间的。
《银河护卫队：超级武器》整体更像于国产卡牌游戏的表现形式，刷图，获取新的角色、刷图……。但是与其不同的是在游戏的战斗形式上面，排兵布阵不再单纯是自动化战斗，而是完全依靠玩家拉线式操作。角色之间的技能关联也不再是文字描述，而是依靠玩家操作体现。最多四个角色的战斗搭配，如果操作不好很容易手慢脚乱全军覆没。需要大家注意的是全2D的构图横向具有阻挡效果，但是纵向会引起重叠效果，排兵布阵时注意拉开纵角色向间距，以免引起错操。
