游戏操作上本作摒弃了前作中的划线与重力感应，采用最为传统的虚拟摇杆与按键操作，不论是投球还是击球，都能做到轻松上手。击球手模式下，屏幕左下角控制细微左右移动距离，右下角控制击球，击球分为两个动作，一个是普通的击球，如果把握时机准确的话，还可以把球打进观众席里，另一个则是不击打棒球，直接手握棒球杆横放，击球手击中球杆后，队员们进行跑位，不要觉得这很无聊，其实这也是战术的一种，棒球运动的规则在棒球明星2013里基本得到了呈现，进攻技术包括击球，跑垒，滑垒，防守技术方面包括接球，传球，投球，触杀，封杀和追杀等。当然全垒打才是最厉害的因为这样你就能直接得分。

　　游戏模式上分为了我的击球手与我的投球手两种，玩家将体验两种不同性质的棒球运动员在赛场上的作用，一开始游戏会让玩家选择击球手还是投手，并且击球手和投手的操作模式有不同之处，击球手模式下，首先会让玩家选择投球的类型，大致分为快速，变速，伸卡，曲球等等，玩家可以根据自己擅长的类型进行选择，触摸一个类型选择完毕之后，屏幕中央会有一个九宫格的框，并且框里还有一个蓝色瞄准图标，这东西的作用是，展示投球手投球最后的落脚点，屏幕左下角的棒球图标，触摸后可以进行调整落脚点位置，屏幕右下角则是投球按钮，但是玩家需要注意的是投球后两手必须持续按住调整位置按钮以及投球按钮，不然球会落向正中间，并且玩家所调整的方向，最后落脚点的位置还是会有一定误差，所以在准备过程中就得把一切给仔细考虑清楚。