下面我们来看看这两款不同平台上的魔力宝贝的对比。碍于篇幅关系，画面及音乐方面的区别就此略过，重点放在核心系统。

　　职业系统：原作中玩家有多达三十四个不同职业的选择，职业大致又可以分为生活类职业和战斗类职业。职业的多样性使得彼此之间存在竞争和配合，单一职业的能力有很大的局限性，于是间接的促进了玩家之间的交流，增强了游戏体验；而这一特点在手游版中已经荡然无存。受到移动平台自身限制，手游版的职业只剩下五种，而且是那种一听名字便知能力、市面上主流游戏的标准职业配置——剑士、忍者、法师、传教士和弓箭手。职业的单调使得手游版在战斗系统上先天不足，玩家和玩家之间没有建立人际关系的可能，削弱了人们长时间上线的动力。

　　佣兵系统：原作中的佣兵系统和手游中的佣兵系统截然不同，前者是自身雇佣或者申请成为佣兵进行战斗或者协助战斗，这种玩法较为简单。而手游版中该系统进行了强化，在召唤佣兵进行协助作战的基础上，玩家可以通过抽取卡包以及其他手段来提升佣兵的实力。玩家每天都会有五次机会来抽取佣兵高级卡包以及一次机会来抽取传奇卡包，能否获得好属性的佣兵需要一定的运气。得到好属性的佣兵后，还可以通过搜集装备来进阶，等到玩家收集齐六件魂器装备就可以对你的佣兵进行进阶了。显然，手游版的佣兵系统更为全面。

　　宠物系统：原作之所以成为经典也正是在这方面有独到之处，在魔力宝贝PC版中，有几百种野生宠物在为勇者服务。或许是首次测试的原因，手游版中无论是宠物来源还是种类，相对于原作来说都有很大不足，目前只有扭蛋一种方式能够获得宠物。另外在游戏中遇敌会碰上宠物宝宝，但是笔者在战斗中就是没找到抓住这个宝宝的方法，不知道将来能否还原原作抓宠的设定。