游戏的战斗系统是本作的核心内容。扫雷怎么和卡牌游戏相结合？虽然因为智龙迷城的示范，很多手游都采用了益智+卡牌的形式（从俄罗斯方块到接水管等），但扫雷倒似乎还真没有。大部分将益智和卡牌相结合的游戏，战斗都只有一部分。这次的《封印勇者》则是做成了两部分：地图扫雷+触摸战斗。
在游戏中玩家进入一个副本时，首先要经历的是地图扫雷的阶段。在地牢中会有N颗雷，大致玩法和扫雷一样，玩家要做的就是找出它们并长按封印住它们（如果误触了则会扣除血量），当一层中的“雷”都被排掉时（副本顶部石像处会显示数量），则会开启下一层的大门。扫雷部分除了为玩家带来新鲜的体验，其实还提供了不少类似于宝石和宝箱的东西让玩家获取回复。
触摸战斗部分，其实才是真正的主体。有些类似于《勇者前线》开创出的触摸战斗。也就是玩家点击相应的角色就会发动攻击，连续点按则能触发连击。不过加入了时间性，怪物会不断向你靠近过来，而玩家也会不断读条（读满才可发动进攻），当碰到你时则发动攻击。这一改动让战斗更具紧张感和爽快感。
